文治の勅許とセットで不可分な要素として実施されたのが、全国への守護・地頭設置である。これにより、頼朝の支配力は鎌倉周辺にとどまらず、日本全国の荘園や公領にまで一気に波及することとなった。
守護は国ごとに置かれ、軍事や治安維持を統括した。一方、地頭は各荘園・公領に配置され、現地での税の徴収や土地管理を直接担った。それまで現地の武士たちは、荘園領主である京都の貴族や大寺社に従属していたが、地頭に任命されることで頼朝と直接の主従関係を結ぶことになる。治安権力と徴税権力を武士が直接握ったこの構造改革こそが、実質的な鎌倉幕府の完成を意味していた。
