もがめ食堂を語る上で欠かせないのが、吉祥寺エリア内における店舗の歩みとロケーションの変遷です。もともと吉祥寺南口の末広通り周辺で小さな名店としてスタートし、その後、東町（ヨドバシカメラ裏エリア）や北口のサンロード商店街へと展開を広げてきました。
現在、吉祥寺で多くの人が訪れる拠点となっているのが「もがめ食堂 サンロード店」です。吉祥寺本町1丁目の地下1階に位置し、雨の日でも商店街のアーケードを通って濡れずにアクセスできる抜群の利便性を誇ります。地下特有のこぢんまりとした隠れ家的な落ち着きがありながら、威勢の良いスタッフの活気が店内に満ちています。
一方で、かつて存在した店舗や系列の移転・再編の経緯について、ネット上では「今どこに行けば食べられるのか」と混乱する声も散見されます。2026年現在の営業状況としては、サンロード店が主軸として安定した営業を続けており、ランチタイムからディナータイムまで通し営業（またはアイドルタイムを短く設定した体制）で多くのファンを迎え入れています。訪れる際は、北口サンロード内の店舗を目指すのが最も確実なルートです。
