ネット検索で頻繁に上位浮上する「山本賢太 結婚」や「山本賢太 彼女」というキーワードですが、取材および公式発表資料によると、現在彼が結婚しているという事実はなく、独身を維持しています。
過去には一部ネットメディアやSNS上で、同局の先輩である杉原千尋アナウンサーらとの親密ぶりが取り沙汰されたことがありました。しかし、これらはYouTube公式チャンネル『フジアナ会話』や番組内での息の合った掛け合いが発端となった憶測に過ぎません。現場スタッフの証言によれば、「プライベートでの交際関係ではなく、バラエティでのノリを共有できる良き先輩・後輩関係」であることが確認されています。
自身のInstagram(@yamamoto_kenta.yamaken)などでも発信されている通り、休日はトレーニングや野球関連の活動、同僚との食事などが中心であり、現在はアナウンサーとしてのキャリア形成に全力を注いでいる時期と見受けられます。