週末や行楽シーズンに水元公園を訪れる際、最大の関門となるのが園内アクセスの見極めです。現地調査に基づく「水元公園駐車場混雑状況」の傾向として、特に天候に恵まれた週末やイベント開催時、公園中央広場に近い第1駐車場（約310台）は午前10時前後に満車となり、水元大橋付近のアクセス道路に長蛇の車列が発生します。
バーベキュー広場に近い内溜側の第2駐車場や、水辺のふれあいルームに近い東側の第3・第4駐車場も含めると園内全体で1,000台規模のキャパシティが用意されていますが、敷地が細長く全長約2km超に及ぶため、「目的地と違う駐車場に停めてしまい、目的のエリアまで20分以上歩行する」というミスマッチが多発しています。車で来園する場合は、午前9時半までの入場が快適な利用のボーダーラインとなります。
一方、公共交通機関を利用する場合は、JR常磐線・京成電鉄の「金町駅からのバスアクセス方法」を把握しておくことが混雑回避の近道です。金町駅南口からは京成バス（金61系統・八潮駅南口行き等）が頻発しており、「公園西口」または「水元公園」停留所まで約7分から10分で到着します。さらに3月から11月の土日祝日には、金町駅南口から水元公園中央広場を結ぶ周遊循環バス（金63系統）が運行されており、混雑する中央エリアへダイレクトにアクセス可能です。駅から徒歩で向かった場合は約25分から30分を要するため、体力温存の観点からもバスの積極的な活用が賢明です。
