ホテルグリーンプラザ軽井沢のもう一つの柱が、敷地内から湧出する「奥軽井沢温泉（浅間温泉の源泉）」です。泉質は「ナトリウム・カルシウム-塩化物・炭酸水素塩温泉（低張性 中性 温泉）」で、保温効果と美肌効果に優れています。地下深くから汲み上げた天然温泉を満喫できる露天風呂、岩風呂、洞窟風呂、内湯が揃い、大自然の澄んだ空気を感じながらリフレッシュできます。大浴場内にはベビーチェアやベビーソープ、脱衣所にはベビーベッドが完備されており、小さな子供との入浴も安心です。
夕食・朝食のグルメバイキングは、約50種類以上の和洋中メニューが並びます。ライブキッチンで焼き上げるローストビーフや揚げたての天ぷらに加え、特筆すべきは「キッズバイキングコーナー」と「離乳食バー」の存在です。子供の手が届く高さに設置されたレーンには、ポテトや唐揚げだけでなく、栄養バランスに配慮した温野菜やうどんが並びます。さらに、月齢別（5ヶ月・7ヶ月・9ヶ月・12ヶ月頃）の市販レトルト離乳食が常時複数種類用意され、無料で提供されている点は、多くの親世代から高い支持を集めています。
