患者が最も切実に向き合う疑問が、「この耐え難い痛みはいつまで続くのか」という点です。臨床データおよび患者の経過観察記録を統合すると、液体窒素の痛みは施術直後から72時間にかけて特徴的な推移をたどることが分かっています。
施術の瞬間は、マイナス196℃の超低温に触れた組織が凍結し、「焼かれたような鋭い熱痛」が走ります。しかし、本当の試練は処置室を出た後に始まります。凍結された患部が体温で解凍される過程で毛細血管が一気に拡張し、炎症性物質（プロスタグランジンやブラジキニン）が大量に放出されるためです。
液体窒素によるイボ治療における痛みのピークは「施術後30分から6時間後（当日の夜）」に集中します。患部が心臓の鼓動に合わせてズキズキと激しく拍動し、何かに軽く触れただけでも飛び上がるほどの痛覚過敏状態に陥ります。足の裏や指先など神経が密な部位では、痛みのあまり就寝できず睡眠不足に陥る患者も珍しくありません。
発症から24時間が経過すると、急性炎症による鋭い拍動痛は次第に沈静化します。その後、48時間から72時間にかけては、組織液が溜まることで生じる「水ぶくれ」や「血豆」の内圧による圧迫痛へと痛みの性質が変化していきます。患部を直接圧迫しない限り自発痛は軽快し、通常は3日（72時間）前後で日常生活に支障のないレベルへ落ち着くのが標準的な経過です。
