武器改造を進める中で、プレイヤーが最も躓きやすいのが「改造の戻し方（初期化）」と「周回プレイ時の引き継ぎ仕様」です。
一度素材を貼り付けてしまった武器を元の状態に戻したい場合、対応する鍛冶屋で「別の素材で上書きする」か、特定の適材ルートから外れた素材を馴染ませて派生をリセットする手順が必要です。ただし、完全に初期状態（未改造のベース武器）に戻せないケースもあるため、高額な固有武器を改造する際は事前のセーブが鉄則となります。
また、リマスター版における「引き継ぎ設定」では、改造済み武器の取り扱いに注意を払う必要があります。引き継ぎ項目で「アイテム」を選択していれば丹精込めて鍛えた武器を次周へ持ち越せますが、イベント進行で一時的に手放す固有装備や、特定のシナリオ進行フラグに紐づくアイテムは消失するリスクがあります。周回突入前には、どの武器が手元に残るのかを用心深く確認しておきましょう。
