熊本県阿蘇郡高森町に位置する同社へのアクセスは、自家用車またはレンタカーの利用が最もスムーズです。熊本市内からは車でおよそ1時間30分、阿蘇くまもと空港からは約1時間の距離にあります。公共交通機関を利用する場合は、南阿蘇鉄道の高森駅から町営バスまたはタクシーを利用するルートが一般的です。
神社の入口向かいには無料の観光駐車場が整備されています。ただし、週末や行楽シーズンは午前中から満車になるケースが目立ちます。ゆったりと静寂を味わいたい場合は、混雑がピークを迎える前の午前8時〜9時台の早朝参拝を目指すと、神秘的な雰囲気を独占しやすくなります。