小学校選びや住まい探しにおいて最も確認が欠かせないのが、日吉台小学校の通学区域（学区）の境界線です。横浜市教育委員会の公式指定データに基づくと、主な対象区域は以下の通りに指定されています。
- 港北区日吉本町1丁目（全域）
- 港北区日吉本町2丁目（一部）
- 港北区日吉本町3丁目（一部）
- 港北区日吉2丁目（一部）
学区内のすべての児童は、原則として公立進学の場合横浜市立日吉台中学校への進学ルートが設定されています。日吉本町1丁目から2丁目にかけては、駅前の商業利便性を享受しつつ、少し奥に入ると落ち着いた邸宅街が広がるエリアです。地勢的には日吉特有の起伏（台地と谷戸のアップダウン）があり、通学路には坂道が存在しますが、歩道幅の確保されたルートも多く、地域のボランティアや見守り隊による登下校時の巡回が根付いています。
また、駅東口には慶應義塾大学日吉キャンパスが広大に広がり、西口の商店街には学生やファミリー層が行き交う活気があります。居酒屋などの飲食店が連なる商店街を通過するルートについては、保護者の間で「夜間の治安」を心配する声も一部ありますが、通学時間帯である朝や昼下がりは通学路誘導員やPTAの旗振りがしっかりと機能しており、重大なトラブルの報告は見られません。
