「離島へ日帰り観光に行きたいけれど、大きなスーツケースが邪魔になる」という場合でも、離島ターミナル内の設備を活用すれば身軽に行動できます。
館内には多数のコインロッカーが設置されており、小型サイズから特大のスーツケースが入る大型サイズまで揃っています。また、繁忙期にロッカーが満杯になった場合でも、ターミナル内の各船会社カウンターや売店、併設の観光案内所にて有人の手荷物預かりサービス（1個あたり日額数百円程度）を実施しているため安心です。
船に乗る前の注意点として、西表島の上原港行きなどは海上の波の高さによって欠航することがあります。上原便が欠航した際は大原港経由の振替バスが手配されるため、移動時間が通常より延びることを見越してスケジュールを組んでおきましょう。
