中学校生活を彩る大きな要素である松山市立余土中学校の部活動は、文武両道を掲げて活発に行われています。運動部では軟式野球、サッカー、バスケットボール、バレーボール、ソフトテニス、卓球、陸上競技などが松山市中学校総合体育大会(市総体)や中予地区大会で上位進出を目指して日々汗を流しています。
文化部においても吹奏楽部や美術部などが熱心に活動を展開しており、地域のイベントやコンクールで存在感を発揮しています。平日の練習時間や休日の活動日数については、教員の働き方改革および生徒の休養日確保のガイドラインに沿って適切に管理されており、学業と無理なく両立できる環境が整っています。