水族館訪問を完璧な旅行体験へと昇華させるには、交通動線と地元グルメの事前把握が欠かせません。JR小樽駅前バスターミナルからは、北海道中央バス（小樽市内線・おたる水族館行き）が運行しており、所要時間約25分で水族館の正面玄関へ直付けできます。運行本数も日中は1時間に2〜3本確保されており、レンタカーを持たない個人旅行者でもアクセスは極めてスムーズです。
観光後のランチにおいて、水族館の敷地真向かいに店を構える「民宿 青塚食堂」の存在を外すことはできません。店先で炭火の煙を立ち上らせながら巨大なにしんを丸ごと一本串刺しにして焼き上げる名物「特大にしん焼き定食」は、遠方から通い詰めるファンが絶えない小樽の名所です。
水族館内のレストランでも、にしんそばや北海道産の海鮮ラーメンを手軽に楽しめますが、漁師町・祝津の風情と本物の磯の香りを堪能したいのであれば、水族館見学の前後に青塚食堂へ立ち寄るコースが最も王道の旅程設計となります。
