道路交通の乱れが予想される台風接近時や連休最終日の午後など、陸路の定時性が脅かされる局面ではJR日豊本線を活用した鉄道バイパスルートが有効な保険となります。
具体的には、大分駅からJR特急「ソニック」または「にちりん」に乗車し、約25分で杵築（きつき）駅へ移動します（普通列車の場合は約40分）。杵築駅前から大分空港行きの国東観光路線バス（所要約30分）に乗車するか、あるいは駅常駐のタクシー（約25分・約5,000円〜6,000円）へ乗り継ぐことで、別府市内の大渋滞区間を完全にパスして空港へ到達できます。
一方、乳幼児連れのファミリーや高齢の同伴者がいる場合、重いキャリーケースを抱えての乗り換えは肉体的な負担が大きくなります。こうしたケースでは、主要タクシー会社が提供する大分空港タクシー定額料金プランが真価を発揮します。事前に指定場所（自宅や宿泊ホテル、大分駅前）を予約しておけば、ドア・ツー・ドアで空港出発ロビー前まで直行できるため、乗り換えのストレスや荷物運搬の苦労から完全に解放されます。
