玉ねぎの栽培現場で最も多い誤解は、「苗を植えた後の追肥でサイズを大きくできる」という思い込みです。農学的な植物生理データや園芸の専門機関が示す通り、玉ねぎは植え付け初期の活着（根が土壌に定着すること）から冬越しの間にどれだけ健全な根群を形成できたかによって、春先の玉の肥大能力が決まります。
根が浅い玉ねぎは、土壌が硬直化していたり過湿状態に陥っていたりすると、酸素不足で即座に根腐れを起こします。また、酸度調整を怠って日本の自然土壌に多い強い酸性（pH5.5以下）のまま植え付けると、リン酸などの必須養分が土中に固定され、根が栄養を吸収できなくなります。これが「春になっても葉が増えず、球が太らない」という現象の根本原因です。土壌環境を整えることは、単に栄養を与えるだけでなく、根がストレスなく呼吸し吸水できる環境を整える作業にほかなりません。
