車で移動するドライバーにとって最も注意すべきポイントが、東横イン金山の駐車場・予約・料金システムです。都心部のホテルでは駐車場事情がシビアですが、東横イン名古屋金山も例外ではありません。
敷地内には立体駐車場および平置きスペースが用意されていますが、収容台数は約30台前後と限定的です。料金は1泊あたり1,000円〜1,500円程度（利用時期・車種により確認が必要）と、金山駅周辺の相場と比較してもリーズナブルに設定されています。
決定的な注意点として、東横イン名古屋金山の駐車場は「電話による事前完全予約制」を採用しているケースが基本となります。WEB予約時に駐車場は自動確保されず、宿泊予約完了後に直接ホテルへ電話を入れて車種・サイズを伝え、空き枠を押さえる必要があります。ハイルーフ車や大型ミニバンの場合、立体駐車場の車高制限（全高1.55m〜2.0m等）に引っかかることがあるため、車検証のサイズを確認した上で問い合わせることが不可欠です。
万が一敷地内が満車だった場合でも、ホテル周辺にはコインパーキングが点在しています。ただし、24時間最大料金の設定がない駐車場や、夜間打ち切り料金のないパーキングに停めてしまうと高額になるリスクがあります。周辺のタイムズや名鉄協商パーキングなど、最大料金設定のある提携外駐車場をあらかじめ複数リサーチしておくことが推奨されます。
