鉄道利用者には至便な同館ですが、名神高速道路の草津田上ICや栗東ICを利用して車でアクセスするドライバーには、事前に知っておくべき決定的なハードルが存在します。それが東横INN琵琶湖線南草津駅西口 駐車場 満車問題です。
ホテルの敷地内には立体駐車場を中心に駐車スペース（1泊あたり約1,000円）が用意されているものの、収容台数は約60台程度に限られており、完全先着順（予約不可）となっています。滋賀県南部の物流拠点や工業団地へ向かう出張客、観光シーズンのマイカー利用が重なる平日夕方や休日午後には、18時前後に敷地内が満車となる事態が日常的に発生します。
万が一敷地内が満車となった場合、ホテル提携の専用駐車場はなく、近隣のコインパーキングを自己手配する必要があります。南草津駅周辺には複数の24時間コインパーキングが存在し、入出庫なしの24時間最大料金は800円〜1,200円程度と敷地内駐車場と同水準ですが、夜間は駅利用者で埋まる区画も少なくありません。車での宿泊を予定している場合は、16時台の早いチェックインを目指すか、あらかじめ駅周辺の予備駐車場を複数リストアップしておく危機管理が不可欠です。
