事件発生直後、長野県警察は直ちに特別捜査本部を設置し、容疑者の身柄確保と全容解明に全力を挙げた。しかし、最初に駆けつけた警察官が散弾銃による急襲を受けた際、防弾ベストを着用していなかった点や、危険情報が即座に現場捜査員へ共有されていたかという初期対応の課題が残された。
警察庁もまた、本事件の教訓を踏まえた全国的な装備・通報体制の再点検を命じた。地方警察における特殊装備の配備状況や、銃器を使用した立てこもり事案における特殊部隊（SAT）の投入タイミングなど、警察組織全体の運用見直しに向けた本格的な検証作業が進められている。
