科学や医学的なアプローチとは別に、スピリチュアルや潜在意識の分野においても、寝起きの涙には特別な解釈がなされています。
スピリチュアルな観点では、睡眠中は肉体の束縛を離れ、魂がより高次の領域や潜在意識の深層とアクセスしている時間とされています。この文脈において、起きたら泣いてたスピリチュアルな意味は「魂レベルのデトックス」や「過去世からのカルマの解放」と捉えられます。
また、大きな人生の転換期を迎えている際、古い自分から新しい自分へと脱皮する過程で生じるエネルギーの摩擦が、目覚めの涙として現れるという見解もあります。夢の具体的な内容は思い出せなくても、目覚めたときに不思議な温かさや感謝の念が湧き上がる場合は、潜在意識が前向きな変化を受け入れたサインと解釈されるケースが一般的です。