春のハイシーズン、特に大型連休中は周辺道路を含めて非常に激しい混雑が発生します。過去の傾向を踏まえた富士本栖湖リゾートの混雑予想では、午前10時から午後14時にかけてが入園ゲートおよび周辺駐車場のピーク時間帯となります。主要アクセス路である国道139号線は渋滞が発生しやすく、移動時間が想定の倍以上になるケースも珍しくありません。
快適に現地を楽しむための最大の裏ワザは、「開園直後(午前8時台)の到着」または「14時30分以降のレイト入場」を選択することです。早朝は空気が澄んでおり富士山がくっきりと見えやすいメリットがあり、午後遅めの時間帯はツアーバスの退園が始まるため園内が落ち着きを取り戻します。また、中央自動車道経由だけでなく、静岡側の新東名・新富士ICルートを活用することで、河口湖周辺のボトルネック渋滞を回避できる場合があります。