ミドリガメは本来非常にタフな生き物ですが、飼育環境下で命を落とすケースには明確なパターンが存在します。エキゾチックアニマル専門獣医師の臨床報告や学術症例において、ミドリガメの死因となる病気の筆頭に挙げられるのが「代謝性骨疾患（MBD・くる病）」と「呼吸器感染症（肺炎）」、そして「ビタミンA欠乏症」です。
特に危険なのが、紫外線照射が不足することでカルシウムの吸収に必要なビタミンD3が体内合成できなくなり、甲羅や骨格が柔らかく変形してしまうMBDです。甲羅がペコペコとへこむ状態に陥ると内臓が圧迫され、激痛とともに衰弱死します。また、水質悪化から細菌が繁殖して目を覆う白い膜が生じるビタミンA欠乏症（ハーダー氏腺炎）や、水温の急変から鼻水を垂らし口を開けて呼吸困難に陥る肺炎も、発見が遅れれば致死率が極めて高くなります。
そして、病気以上に多くの飼育個体の命を一瞬で奪うのが「冬眠の失敗」です。ネット上や昔の飼育書には「カメは自然に冬眠させるのが当たり前」という記述が見られますが、現代の爬虫類獣医療において、一般家庭での安易な冬眠は「最も避けるべき自殺行為」と警告されています。
現場で多発するミドリガメの冬眠の失敗原因は以下の3点に集約されます。
- 体脂肪・エネルギーの枯渇：成体であっても、秋口までに十分な栄養を蓄えられていない個体は、冬の間に自らの筋肉や内臓組織を分解してしまい、春先に目覚める体力を失ってそのまま衰弱死する。
- 不完全な冬眠温度による体力消耗：水温が中途半端な8℃〜14℃前後を推移すると、代謝が下がりきらないまま活動エネルギーを消費し続け、免疫機能だけが低下して体内で細菌感染爆発を起こす。
- 水質の腐敗と極度の乾燥・凍結：冬眠中であっても水中の細菌は生きています。底砂のヘドロ化や換水不足による水質悪化で皮膚が腐敗するか、あるいは水深不足によって甲羅ごと凍結して命を落とす。
野生下では冬眠に失敗した個体は静かに淘汰されますが、家庭飼育において冬眠をさせる医学的メリットは「繁殖を目的としたクーリング（性腺刺激）」以外にほぼ皆無です。ペットとして健康に40年の寿命を全うさせるのであれば、冬場は水中ヒーターを導入して水温を24℃〜26℃にキープし、通年で活動させる「無冬眠越冬」を選択することが現代飼育の常識です。
