予約時や訪問前に必ず頭に入れておかなければならないのが、施設のハウスルールとアクセス手段です。まず館内の神戸みなと温泉蓮 ドレスコード 服装についてですが、客室内や食事処「万蓮」、温泉フロアに関しては、備え付けの作務衣や浴衣での移動が全面的に認められています。リラックスして過ごせるのが魅力ですが、正面玄関からの入館時やチェックイン時においては、極端な露出度の高い服装やビーチサンダル等での来館は控えるのがスマートな大人のマナーとされています。また、入れ墨・タトゥー（シール含む）のある方の入館は厳格に禁止されており、発見された場合は即座に退館処分となるため注意が必要です。
次に、アクセス面で極めて重要なのが神戸みなと温泉蓮 シャトルバス アクセスの活用です。各線三宮駅（ミント神戸北側のバスターミナル周辺）から専用の無料シャトルバスが毎日運行しており、港の埠頭まで約5分でスムーズに直行できます。しかし、休日の昼前後やチェックアウト直後の午前10時台から11時台は乗車希望者が集中し、定員オーバーで次の便を待たされる場面が見受けられます。新幹線の時間や予定が決まっている場合は、発車時刻の10分前には乗り場に並ぶか、三宮駅からワンメーター強の距離であるためタクシー利用を視野に入れておくのが失敗しない鉄則です。
