三浦孝太を語る上で欠かせないのが、演劇界屈指の芸能一家として知られる家族関係です。父は劇団四季出身で時代劇やサスペンスに欠かせない名優・三浦浩一、母は1970年代にアイドルや女優として一世を風靡した純アリス（2019年逝去、享年66）。そして3人兄弟の末っ子（三男）が、『仮面ライダーオーズ/OOO』のアンク役や数々のグランドミュージカルで絶大な人気を誇る俳優・三浦涼介です（長男は芸能界ではなく教育・一般分野で活躍）。
家族の絆を象徴する出来事として語り継がれているのが、母・純アリスの闘病生活でした。2019年にがんで他界する際、孝太と涼介の兄弟、そして父・浩一は総出で母を支え続けました。当時のインタビューや手記において孝太は、「母が最後まで見せてくれた凛とした生き様と、家族を何よりも愛してくれた温もりが、自分たちの役者としての原点になっている」と深い敬愛を明かしています。
弟の三浦涼介とは互いの舞台を観劇し合い、SNSでも時折ツーショットを公開するなど極めて良好な兄弟関係を築いています。華やかで繊細な表現を得意とする涼介に対し、骨太で重厚な存在感を放つ孝太という、対照的な個性を持つ兄弟俳優として業界内でも高く評価されています。
