花粉症治療薬を服用する際、最大の懸念事項となるのが「耐え難い日中の眠気」や「仕事・学習効率の低下（インペアード・パフォーマンス）」です。結論から言えば、フェキソフェナジン塩酸塩は抗ヒスタミン薬の中で最も眠気を引き起こしにくい薬剤の一つとして、医学的エビデンスが確立されています。
一般的な第1世代抗ヒスタミン薬（ポララミン等）や一部の第2世代抗ヒスタミン薬は、有効成分が脳を守る関門である「血液脳関門（BBB）」を通過し、脳内の覚醒維持に関わるヒスタミン受容体をブロックしてしまいます。これが中枢抑制作用、すなわち強い眠気の直接的な原因です。これに対し、フェキソフェナジン塩酸塩は脂溶性が低く、脳内へ移行しにくい分子構造を持っています。さらに、脳内にわずかに入り込んだ成分もトランスポーター（P糖蛋白）によって速やかに脳外へ排出される仕組みが働きます。
PET（陽電子放出断層撮影）を用いた原著論文の研究データによると、フェキソフェナジン塩酸塩の脳内ヒスタミンH1受容体占拠率はほぼ0%であることが確認されています。これはプラセボ（偽薬）と統計学的な有意差がないレベルであり、薬理学的に「非鎮静性」に分類される決定的な根拠です。
この事実を最も端的に証明しているのが、医療用医薬品の公式添付文書です。多くのアレルギー性鼻炎薬には「本剤の服用中は、自動車の運転等危険を伴う機械の操作に従事させないよう注意すること」という警告文が義務付けられています。しかし、フェキソフェナジン塩酸塩錠60mgの添付文書には、自動車運転に関する注意喚起の記載が一切存在しません。日中に長距離運転を行う運送従事者、精密作業を担うエンジニア、集中力を維持しなければならない受験生にとって、この安全性の高さは代えがたいアドバンテージとなっています。
