鉄道各社は二次被害防止に向け、早めの運行見合わせを決断している。JR東日本は山手線をはじめとする首都圏各線の段階的な運転取りやめを発表。特に架線への飛来物リスクが高い在来線地上区間については、ピーク時間帯を前に全面的にストップする計画だ。
東京メトロおよび都営地下鉄の一部区間でも、地上線との相互直通運転を中心に運転取りやめや大幅な本数削減が始まっている。東海道・山陽新幹線も都内区間の遅延や運休が相次いでおり、ターミナル駅構内では運転再開を待つ利用者の混雑を避けるため、構内規制が実施される可能性がある。