藤谷美紀の私生活に目を向けると、芸能人特有の派手なゴシップとは無縁の、極めて堅実で温かな家庭を築いていることが分かります。
2012年11月、当時39歳だった藤谷美紀は、かねてより交際していた一般企業に勤務する同い年の男性との結婚を発表しました。お相手は高校時代の同級生であり、卒業後長い年月を経て再会し、約数年間の真剣交際を経てゴールインに至ったと報じられています。入籍発表時のコメントでも、飾らない人柄と互いを尊重し合う信頼関係が滲み出ており、多くのファンや関係者から温かい祝福を受けました。
その後、2013年2月に第1子となる男児を出産。さらに2015年3月には第2子となる女児を出産しています。2026年現在、長男は13歳(中学1年生〜2年生)、長女は11歳(小学5年生〜6年生)の成長期を迎えています。
芸能関係者の間でも、彼女の徹底した教育方針と家庭優先のスタンスはよく知られています。学校行事や日々の送迎、手作りの食事など、母としての役割に真摯に向き合う姿が近隣住民や保護者仲間からも目撃されており、地に足の着いた暮らしを選択したことが現在の充実につながっています。