急速な人気高騰に伴い、マリンアクティビティ産業における過度な混雑や生態系への影響が心配された時期もあった。しかし現在では、環境省や一般社団法人八重山ダイビング協会が主導し、厳格な自主ルールと利用自主規制が敷かれている。
マンタに触れないこと、真上から追いかけないこと、水中で大声をあげないことなど、持続可能なエコツーリズムの精神が徹底されている。美しい八重山諸島の豊かな海とナンヨウマンタの生息環境を次世代へ引き継ぐための取り組みは、地域社会と観光客が一体となって育む新たな保全モデルとして高い評価を得ている。
