清掃やリセットを試しても完全に動かない、あるいは充電できない状態が続くなら、任天堂の公式サポートへ修理を依頼するのが最も安心できるルートだ。
気になる費用だが、Joy-Con片方（1本）の修理参考価格は税込2,200円前後（※内部基板の全損など重度の故障を除く）となっている。任天堂公式サイトの「オンライン修理受付」から申し込むことで、修理代金が5%割引になる特典が適用されるため、Web経由での申し込みが基本だ。
保証期間内（購入から1年以内）で自然故障と認められれば無償修理となる。保証書や購入時のレシート・納品書を忘れずに同封しよう。発送から手元に戻るまでの期間は通常1週間〜10日前後が目安となるが、連休前後や繁忙期は日数が延びることもあるため余裕を持って依頼したい。
