上色見熊野座神社は普段神職が常駐していない無人社であるため、境内の社務所では御朱印の授与を行っていません。御朱印や各種お守りを希望する場合は、車で約10分ほどの距離にある「高森町観光交流センター」または指定の窓口へ立ち寄る必要があります。訪問前に受付時間（概ね9:00〜17:00）を確認しておくと確実です。
参拝後は、阿蘇の豊かな湧水を誇る「白川水源」や、雄大な阿蘇五岳を一望できるパノラマライン、名物の「高森田楽」を味わえる食事処など、高森町周辺の観光名所とセットで巡るルートを組むと、南阿蘇の自然と文化を余すところなく堪能できます。
