術後の傷跡経過は、採用された施術方法によって大きく異なります。ほくろ除去の代表的な手技である「炭酸ガス（CO2）レーザー蒸散術」と「くり抜き法（メスによる円形切除）」では、組織の深達度とダウンタイムの実態が全く違います。
炭酸ガスレーザーの場合：浅い層の蒸散と早期の上皮化
直径3mm未満の平らなほくろや比較的小さなものに適応される炭酸ガスレーザーは、水分に反応するレーザー光でほくろ組織を瞬間的に蒸散させます。熱凝固作用によって出血が少なく、ダウンタイムは比較的短めです。
術直後は皮膚がすり鉢状に凹み、赤褐色になりますが、術後7〜10日程度で新しい表皮が再生（上皮化）します。この期間中は浸出液が適度に出るため、医療用テープや軟膏による保護が不可欠です。上皮化が完了した後はピンク色の皮膚が現れ、徐々に周囲の肌色へと馴染んでいきます。
くり抜き法の場合：深い真皮欠損と長期間の組織再構築
真皮深くまで母斑細胞が存在する盛り上がったほくろや、5mm前後の大きめのほくろに対して行われるのがくり抜き法です。組織を円形にくり抜いた後、傷を縫合せずに開口したまま肉芽組織の増殖を待つケース（二次治癒）が多く見られます。
くり抜き法における浸出液の分泌期間はレーザーよりも長く、約2〜3週間にわたる厳重な被覆管理が求められます。肉芽が下から盛り上がって穴が埋まるまでに時間を要するため、途中で無理に乾燥させたり、粘着力の強いテープで刺激を与えたりすると、深いくぼみがそのまま固定化してしまう危険性があります。
