国内外の主要コミュニティ（Reddit、百度貼吧、日本のWeb小説読者フォーラム）における生の声を分析すると、読者が本作を絶賛する理由は共通して「脱・紋切り型」にあります。
一般の仙侠小説では、「身勝手な理由で主人公を侮辱する悪役」「宝物を巡る無益な私闘」「インフレするだけの階級制」が繰り返されがちです。しかし『牧神記』を読了したユーザーからは、次のような熱い反響が寄せられています。
「最初はよくある復讐・成り上がりかと思ったが、延康国の変革編に入ってから化けた。『民生のための神神通（民のために神術や科学を使う）』という理念に感動した」
「残老村のジジババたちが最高に格好いい。主人公を溺愛しつつも、過酷な現実を生き抜く知恵を叩き込む師弟関係が尊い」
「秦牧の性格がただの善人でも冷酷無比な狂人でもなく、機知とユーモアに富んでいて読んでいて飽きない」
退屈な修行描写を排し、常に知的サスペンスと熱い信念のぶつかり合いが描かれる点が高く評価されています。
