福岡市役所本庁舎へのアクセスは、公共交通機関の利便性が極めて高いのが特徴です。最寄り駅である西鉄福岡（天神）駅から徒歩約4分、地下鉄空港線天神駅からは地下街経由で徒歩約5分、地下鉄七隈線天神南駅からは徒歩約3分でアクセス可能です。雨天時でも地下街からほぼ濡れずに市役所地下通路へと進入できる動線が確保されています。
一方、自家用車で来庁する場合、市役所地下駐車場の収容台数は約130台用意されています。基本料金は30分200円（8:00〜22:00）となっており、市役所窓口での各種申請や相談などの公的用務がある場合は、訪問先の窓口で駐車券の認証を受けることで原則60分間（手続き遅延等の場合は所要時間）の無料割引が適用されます。
ただし、平日昼間や隣接する「福岡市役所前ふれあい広場」で大型イベントが開催される週末は、駐車場入口に行列が発生し入庫までに30分以上要することも珍しくありません。商業目的の駐車は割引対象外となるため、天神中心部への移動は可能な限り地下鉄や西鉄バスの利用が合理的です。
