参拝の証として拝受したいのが、丁寧に墨書きされる飛騨山王宮日枝神社の御朱印です。通常いただける神社の社号印が押された端正な御朱印に加え、春の高山祭期間中には特別な意匠をあしらった限定御朱印が頒布されることもあり、多くの朱印愛好家から注目を集めています。
社務所では、開運厄除や交通安全、日枝神社の神使である猿(神猿・まさる)にちなんだ「魔が去る」「勝る」とされる縁起の良いお守りも充実しています。社務所でのお守りや御朱印の授与時間は午前8時30分から午後5時頃までとなっていますが、祭礼の期間や年末年始などは受付時間が変動する場合があります。授与品を希望する際は、時間に余裕をもって午後早めの時間帯までに参拝するのが安心です。