アン・ヨンジュンのプライベートを語る上で最大のハイライトと言えるのが、妻ベニー（Venny）との結婚生活です。お相手のベニーは、2004年にモダンロックバンド「Sang Sang Band（想像バンド）」のボーカルとしてデビューし、映画『カンナさん大成功です！』の音楽指導や大学教授としても活躍する実力派アーティスト。二人は知人の集まりで出会い、4年間の真剣交際を経て2015年9月にゴールインしました。
当時、韓国芸能界でも大きな話題を集めたのが「9歳の年齢差」です。妻が9歳年上という年の差婚に対して、交際当初は周囲からの懸念やメディアの興味本位な視線もありました。しかしアン・ヨンジュンは、自らの意思で誠実にアプローチを重ね、彼女の音楽的感性と自立した人柄を深く尊敬し続けたと、当時のメディアインタビューでも明かしています。
さらに世間の感動を呼んだのが、結婚8年目にして授かった待望の子供（第一子長女）の誕生でした。夫婦で出演したカウンセリング番組などでは、妻が高齢出産（出産当時45歳）の領域に入る中、幾度となく直面した不安や葛藤、そして命を授かるまでの奇跡的な道のりを率直に告白。2023年に元気な女の子が産声を上げた際には、ファンや関係者から祝福の嵐が巻き起こりました。父親となったアン・ヨンジュンは、オムツ替えから沐浴まで積極的に担う育児パパへと進化を遂げています。
