旅行やデートのタイムスケジュールを組むにあたり、新江ノ島水族館の所要時間・見学目安は約2時間〜2時間半をみておくと無理がありません。ショー鑑賞を含めず足早に水槽を巡るだけであれば約1時間半、イルカショーをしっかり観覧し、館内カフェでの軽食やグッズ選びまで楽しむなら3時間程度を確保しておくのが理想的です。
館内には見ごたえのある展示が揃っていますが、中でも世界的な評価を受ける看板エリアがえのすいのクラゲファンタジーホールです。半世紀以上の飼育研究の歴史を持つクラゲ展示は、球型水槽「クラゲプラネット」をはじめ、大小さまざまな水槽でたゆたうクラゲたちと優美な照明・音楽が融合した癒やしの空間です。
このほか、高さ約9メートルの「相模湾大水槽」で展開されるイワシの大群のうねりや、愛らしい仕草で来館者を魅了するカピバラやペンギンの展示エリアなど、見どころが凝縮されています。