現在、滝藤賢一さんの家族構成は夫婦と子供4人の6人家族です。子宝に恵まれ、内訳は上から長男・次男・三男、そして末っ子の長女という3男1女の賑やかな構成になっています。
子育てのリアルな現場について、滝藤さんはインタビューなどで「家の中は毎日がお祭りのような大騒ぎ」と笑顔で語っています。男の子3人の凄まじいエネルギーを受け止めつつ、年の離れた長女には目に入れても痛くないほどの愛情を注ぐなど、父親としての顔も覗かせます。
また、滝藤さんの自宅といえば、趣味の植物(珍奇植物や塊根植物)が所狭しと並ぶジャングルのようなバルコニーが有名です。忙しい撮影スケジュールの合間を縫って、朝の子供たちの送り出しやゴミ出し、散歩をこなし、家族との時間を何よりも大切にしています。お洒落で個性的な私生活の背景には、常に家族の温かい笑顔と賑やかな声が溢れています。