座間味島へのアクセス拠点は、那覇市にある泊港（とまりん）です。島への定期航路は主に2種類運行されており、旅のスケジュールや予算に応じて選択します。
移動の主役となるのは、高速船「クイーンざまみ」。所要時間は直行便で約50分（阿嘉島経由便は約70分）と圧倒的にスピーディーです。一方、大型の「フェリーざまみ」は約2時間かかりますが、揺れに強くのんびりとした船旅を楽しめる利点があります。なお、慶良間諸島国立公園の自然環境を守るため、乗船運賃とは別に美ら島税（座間味村環境協力税100円）が徴収されます。
注意したいのが、オンシーズンにおける高速船のチケット争奪戦です。乗船日の2ヶ月前同日（午前0時）から公式Webサイトで予約がスタートしますが、夏季の午前発・夕方発の人気便は数分で完売することも珍しくありません。満席表記になっていても諦めず、キャンセル料が発生し始める出航7日前や前日の夕方に空席照会を行うと、キャンセル枠を確保できる確率が跳ね上がります。
