月面での直接対決において、千空はホワイマンを力で殲滅するのではなく、「科学を通じた対話と交渉」を試みます。
千空はホワイマンに対し、「不老不死のために石化して眠り続けるのではなく、死の恐怖と戦いながら知恵を絞り、宇宙の果てまで科学を切り拓くことこそが人間の生き方だ」と宣言。メンテナンスロボットとして生きる道を明確に拒絶しました。
人類との共生が成立しないと判断した大半のメデューサ（ホワイマンの群れ）は、新たな寄生先となる知的能力を持った知的生命体を求め、深宇宙へと去っていきます。
しかし、ここで奇跡が起きます。たった1機のメデューサだけが、千空が語った「未知なる科学への好奇心」に興味を抱き、地球に残ることを選択したのです。
地球へと持ち帰られたこのメデューサは千空たちの仲間となり、物語の最終章では、過去に命を落としたすべての人間を救い出すための究極プロジェクト――「タイムマシン開発」の動力源兼パートナーとして、新たな科学の未来へ歩み出すことになります。
