ネット上のQ&Aや日常会話で頻繁に見られるのが、「オレンジジュースとみかんジュースは同じものか」という混同です。しかし、日本の農林規格（JAS規格）および食品表示基準において、両者は厳格に区別されています。
原材料表示において「うんしゅうみかんジュース」と名乗れるのは温州みかんの果汁のみであり、バレンシアオレンジなどの果汁を用いた「オレンジジュース」とは風味特性が根本から異なります。温州みかんジュースは酸味が穏やかでやさしい甘みが際立つ一方、オレンジジュースはクエン酸のキレと特有のテルペン系香気が強く、爽快感が前面に出ます。
また、加工技術の面でも違いがあります。みかんの缶詰などで皮が美しく取り除かれているのは、アルベドの薄さを活かして塩酸と水酸化ナトリウム（どちらも中和・洗浄され残留しません）による薄い酸・アルカリ処理で膜を分解できるためです。対して皮の強固なオレンジではこの手法が難しく、ナイフによる機械皮むきが主流となっています。
