ピコスポットの経過は、皮膚が本来持つ創傷治癒プロセスの段階に沿って推移します。各フェーズで現れる症状をあらかじめ把握しておくことで、ダウンタイム中の過度な不安を回避できます。
施術当日の照射直後、ターゲットとなったメラニン色素はピコ秒（1兆分の1秒）単位の衝撃波によって粉砕され、照射部位は一時的に白っぽく変化する「ホワイトニング現象」を起こします。その後、数十分から数時間で毛細血管の拡張に伴う赤みや軽度の浮腫（腫れ・ヒリヒリ感）へと移行します。このピコスポットの赤みは、保冷剤などによるクーリングを行うことで、多くの場合は施術後24時間から長くとも48時間以内に沈静化します。
照射後2〜3日目を迎えると、粉砕されたメラニンを含んだ変性組織が表皮へと押し上げられ、シミの色が施術前よりも一段と濃く、黒褐色の薄い膜状に変化します。これが「マイクロクラスト（薄いかさぶた）」と呼ばれる状態です。
ピコスポットのかさぶたが剥がれる日数は、平均して5日から10日程度です。洗顔や保湿の過程で垢のようにポロポロと自然に脱落していきます。ピコスポットの経過1週間が経過したタイミングでは、大半のかさぶたが剥がれ落ち、下から透き通るような薄いピンク色の新しい皮膚（新生上皮）が顔を出します。この時期の肌はバリア機能が未熟で非常にデリケートなため、決して指で無理に剥がしてはいけません。
さらに時間が進み、ピコスポットの経過1ヶ月を迎える頃に多くの患者が直面するのが、一度薄くなった部位が再び茶褐色に色づく現象です。これは照射による熱や刺激に反応して一時的にメラノサイトが活性化する生体反応であり、経過観察が必要な重要局面となります。
