ファンの間で最も注目され続けたのが、「コハクと千空は最終的に結婚するのか?」という恋愛フラグの行方です。結論から述べると、物語の完結時点において二人は恋愛関係としての結婚はしていません。
作中では、宝島編での潜入任務において敵を欺くために突発的なキスを交わす場面や、月面着陸ミッションの出発前に千空と強い抱擁を交わすなど、読者をドキッとさせる名シーンが多数描かれました。しかし、千空にとっての最優先事項は常に「科学の力による全人類の救出と文明復興」であり、特定の異性と恋仲になる描写は一貫して排除されています。
一方で、コハクが千空に抱く感情は単なる打算や依存ではなく、「自分たちの世界を広げてくれた恩人」への深い畏敬と、魂レベルでの共鳴です。千空もまた、コハクの戦闘能力と判断力に全幅の信頼を置いており、男女の枠組みを超えた「最強の相棒」として生涯の絆を結んでいます。