県岐阜商を語る上で欠かせないのが、全国に誇る部活動の強さです。特に県岐阜商 野球部は、春夏通算の県岐阜商 甲子園 成績において全国トップクラスの出場回数と通算勝利数を誇る超名門として知られています。
歴代の県岐阜商 監督が築き上げた徹底的な基本動作の反復と、戦術眼を養う独自の育成メソッドは、多くの県岐阜商 出身プロ野球選手を輩出してきました。OBには球界を代表する名選手や指導者が名を連ね、現役プロ選手も活躍を続けています。取材に応じた野球部OBの一人は「技術以上に、社会に出てから即戦力として通用する規律と人間性が叩き込まれる」と現場の厳しさと誇りを振り返ります。
部活動の躍進は運動部にとどまりません。県立岐阜商業 吹奏楽部もまた、全日本吹奏楽コンクールやマーチングコンテストの常連として全国にその名を知られており、一糸乱れぬ演奏とダイナミックなパフォーマンスは県内外から高い評価を集めています。スポーツ・文化両面において「妥協を許さない組織作り」と「生徒の自主性を重んじる指導」が両輪となり、学校全体に高いモチベーションと連帯感を生み出しています。