副鼻腔炎と中耳炎を併発している場合、耳鼻咽喉科では両部位の状態を同時に精密評価します。鼓膜鏡や内視鏡による鼓膜の観察（発赤、混濁、貯留液の有無）に加え、ティンパノメトリー（鼓膜の動きやすさを測る検査）や純音聴力検査を実施し、音を伝える機能がどの程度損なわれているかを測定します。
薬物治療においては、日本耳科学会等のガイドラインに準拠し、原因菌に応じた適切な処方薬が選択されます。ペニシリン系抗菌薬（アモキシシリン等）を中心に、耐性菌が疑われる場合にはクラバモックスやセフェム系が検討されます。同時に、粘液をサラサラにして排出しやすくするカルボシステイン（去痰薬）や、アレルギー性鼻炎が背景にある場合の抗ヒスタミン薬が組み合わされます。
保存的治療で改善しない難治性の滲出性中耳炎に対しては、鼓膜を微小切開して貯留液を吸引する処置や、中耳の換気を維持するための「鼓膜換気チューブ留置術」が行われます。近年では、外来で局所麻酔下に短時間で安全に実施できるチューブ手術が標準化されており、長引く難聴から子どもの言語発達や学習意欲を守る重要な選択肢となっています。
