私立大学への進学で最も気になる学費面についても、新潟青陵大学は充実したサポート制度を整えています。初年度納付金は学部によって異なりますが、概ね130万〜180万円程度（実験実習費等を含む）となっており、地方私立大学の医療・福祉系としては標準的な設定です。
経済的負担を軽減するため、独自の「青陵特待生制度」が用意されており、一般選抜や大学入学共通テスト利用選抜の成績優秀者には授業料の全額または半額が免除されます。国の「高等教育の修学支援新制度」の対象校でもあるため、条件を満たせば授業料減免と給付型奨学金を併用し、国公立大学並み、あるいはそれ以下の負担で4年間学ぶことが可能です。
