ほっかけ寿司のルーツを辿ると、主に四国・徳島県南部（美波町、海陽町、牟岐町など）を中心とする沿岸・山間地域にたどり着きます。かつて祭りや冠婚葬祭、建前（棟上げ）といった特別な「ハレの日」に、集落の人々や親戚をもてなすために大鍋で仕込まれた伝統料理です。
特徴的な名称の由来は、方言の「放っ掛ける（ほっかける＝上から勢いよくかける、ぶっかける）」という動作にあります。大皿に盛った炊きたての酢飯の上から、甘辛く煮詰めた山海の具材を出汁ごと豪快に振りかけた様子からその名が定着しました。
地域の郷土史料や古老の証言によると、冷蔵技術が未発達だった江戸時代後期から明治期にかけて、酢による保存効果と、出汁を染み込ませて冷めても美味しく食べられる工夫が融合して生まれたとされています。漁師町では獲れたての小魚や干物が加えられ、農村部では乾物や根菜がふんだんに使われるなど、地域ごとの風土に合わせた多様なバリエーションが育まれてきました。
