現代の飲食店選びにおいて重要な設備やサービス面についても、磯丸水産 横浜西口南幸店はしっかりとした体制を整えています。
まず喫煙環境についてですが、受動喫煙防止対策に伴い店内席は全席禁煙となっています。ただし、紙タバコ・加熱式タバコの両方に対応した専用の喫煙ブースが店内に設置されているため、愛煙家の方も店外へ出るストレスなく快適に過ごすことが可能です。
座席レイアウトは大衆的なテーブル席が中心となっており、完全個室はありませんが、開放的で視通しの良い空間となっています。予約に関しては、主要なグルメサイト（食べログ、ホットペッパーグルメ、PayPayグルメ等）から事前のネット予約に対応しており、特に週末夜や宴会シーズンの利用時は予約を入れておくのが確実です。
さらに、同店ではテイクアウト（持ち帰り）や各種デリバリーサービスにも注力しています。名物の海鮮丼や焼き魚弁当などを自宅やオフィスへ手軽に持ち帰ることができるため、テイクアウト需要にも幅広く応えています。
