五所川原駅で最も多くの旅行者が迷いやすいのが、JR五能線と津軽鉄道の乗り換えです。両駅は線路を共有しているものの、駅舎と改札口は完全に分かれています。JR側の「五所川原駅」を出て右手へ進むと、レトロな木造の趣を残す津軽鉄道「津軽五所川原駅」の駅舎があります。
改札連絡通路はないため、一度JRの改札を出て切符を買い直す必要があります。特に観光シーズンや冬の繁忙期には津軽鉄道の出札窓口が混み合うため、乗り換え時間は最低でも10〜15分見ておくのが確実です。
JR五能線では、秋田〜青森間を結ぶ人気の快速「リゾートしらかみ」が停車します。全車指定席のため、事前にえきねっと等での座席確保が欠かせません。一方の津軽鉄道はICカード非対応となっており、現金による乗車券購入が基本です。列車本数が限られる地域路線同士の接続となるため、五所川原駅の最新時刻表を事前に照合し、無理のない接続ダイヤを組むことが旅を成功させる第一歩となります。