長崎市内特有の傾斜地地形と路面電車のレール網により、中心街での自家用車移動には常に駐車問題が付きまといます。市民会館の地下に直結する長崎市民会館地下駐車場は、雨天時でも濡れずに館内へアクセスできる唯一無二の利便性を持ちますが、現場では深刻なトラブルと時間ロスが日常化しています。
現地の利用実態を分析すると、収容台数は約110台前後にとどまります。このキャパシティに対して、平日は隣接する市役所来庁者の流入、休日は文化ホールの開場と体育施設利用のピークが重なります。開館直後の午前8時30分〜9時過ぎ、および昼の入れ替え時（12時〜13時）は、進入路であるスロープ付近にハザードを点灯させた進入待ちの車両列が発生しやすく、長崎市民会館混雑状況のボトルネックとして悪名を馳せています。
気になる長崎市民会館地下駐車場料金は、最初の30分無料措置が適用される市役所本庁舎駐車場とは異なり、30分あたり140円前後の従量課金制が基本です（利用施設による減免規定あり。障がい者手帳提示等による免除措置を除く）。終日定額の上限料金（打ち切り料金）が設定されていない、あるいは設定条件が極めて限定的であるため、朝から夕方までホール公演やスポーツ大会で終日停め置いた場合、2,000円前後の出費に達するケースもあります。
「地下が満車で周辺を探し回っているうちに開演ベルが鳴ってしまった」という痛恨の失敗談は枚挙にいとまがありません。週末の大規模公演時は、はじめから近隣の「公会堂前パーキング」や魚の町・興善町界隈の民間提携駐車場、あるいは公共交通機関を選択することが、賢明なリスクマネジメントです。
