利便性の高いホテルである一方、宿泊前に必ず押さえておくべき注意点が2点存在します。それが「駐車場問題」と「客室の空気環境」です。
まず、車で訪れる際に最も警戒すべきなのが東横INN水戸駅南口の駐車場料金と収容規格です。敷地内には立体駐車場と平置きスペースが用意されていますが、完全な「先着順」運用となっており事前予約は受け付けていません。特に立体駐車場には車高・車幅・重量制限（全高1.55m〜2.0m未満の制限枠など）があり、大型SUVやミニバン、ハイルーフ車は平置き区画が埋まり次第、近隣の提携外コインパーキングへ案内されることになります。近隣にも民間駐車場は多数ありますが、連休やイベント開催時には相場が変動するため、車利用者は早めの到着を意識する必要があります。
次に確認すべきは、東横イン水戸駅南口の喫煙・禁煙の部屋選択です。館内はフロアごとに分煙管理が徹底されていますが、週末や繁忙期には禁煙室が先に満室となり、やむを得ず喫煙室を予約するケースが見られます。ホテル側による消臭対応は行われるものの、タバコの臭いに敏感な方や非喫煙者は、予約時点で確実に禁煙ルームを確保することが快適な滞在の絶対条件です。
