物語のクライマックスでは、方舟の動力源である「中枢コア」が実は人工知能によるものではなく、ある重大な犠牲の上に成り立っていたという衝撃的な真実が明かされます。この結末の展開こそが、ネット上で最も激しい考察合戦を生み出している発火点です。
最終盤、主人公たちは方舟の現状維持を選ばず、外の世界へと「胞子」のように旅立つ道を選択します。このラストシーンが「人類の再生を意味する希望の光なのか」それとも「緩やかな絶滅を受け入れた諦観の選択なのか」という解釈をめぐり、読者の間で見解が真っ向から割れています。
伏線として散りばめられていた植物学的な用語や、作中に登場する暦の謎を解読する熱狂的な考察ブログが次々と立ち上がっており、読了後も何度でも読み返したくなる構造の妙が高く評価されています。
