インターネットの掲示板やSNSを中心に根強く囁かれているのが「八田與一はすでに死亡しているのではないか」という仮説です。事件直後、被疑者が履いていたスリッパが現場から離れた別府湾沿いのヨットハーバー付近で発見されたことや、追いつめられた精神状態から「海に入水自殺した」「山林で人知れず命を絶った」という憶測が飛び交いました。
しかし、捜査関係者の証言および警察の公開情報によると、「死亡を裏付ける客観的証拠は一切存在しない」というのが捜査本部の統一見解です。警察当局は、事件発生以降に全国で発見された身元不明の変死体や水難遺体について、指紋およびDNA型の照合作業を網羅的に実施しています。その膨大なデータベース照合において、八田被疑者と一致した検体は一件も確認されていません。
逃走直後の防犯カメラ映像には、裸足で街中を駆け抜け、住宅街や山手方面へと巧みに身を隠す姿が記録されていました。この極めて合理的かつ自己保身に長けた逃走行動パターンからも、突発的な自死を選んだ可能性は低く、警察当局は「現在も偽名や変装を用いてどこかに潜伏・生存している」と断定して捜査網を維持しています。